植物基因组学国家重点实验室（中国科学院微生物研究所、中国科学院遗传与发育生物学研究所）_在线百科全书查询
植物基因组学国家重点实验室（中国科学院微生物研究所、中国科学院遗传与发育生物学研究所）
简要概况
植物基因组学国家重点实验室依托中国科学院微生物研究所、中国科学院遗传与发育生物学研究所，实验室于2003年经国家科技部批准正式成立。其前身是1990年成立的中国科学院植物生物技术开放实验室。2006年1月，实验室通过了科技部组织的国家重点实验室建设验收。2006年，国家重点实验室评估中被评为优秀实验室。植物基因组学国家重点实验室现任主任为方荣祥院士，学术委员会主任为李家洋院士。
研究领域
实验室总体定位：从国家战略需求出发，以主要农作物和经济作物以及重要模式植物为材料，系统地开展植物和植物病原微生物的功能基因组学研究，着重于大规模新基因的克隆鉴定、功能分析和潜在应用价值的探索，推动植物生物技术的源头创新和转基因植物产业化。建立我国植物基因组学理论体系和技术平台，使实验室成为国内植物基因组学源头创新研究的中心，不断提高在国际上的竞争力和影响力。
项目成果
2008年，实验室人员共承担各类研究项目121项，发表论文81篇，其中以主要作者在Annual Reviews of Plant Biology、Nature Genetics、Plant Cell、PLoS Genetics、Plant Journal、Plant Physiology 和Journal of Virology等国际主流刊物发表SCI论文61篇。
科研进展
实验室在植物分子生物学领域及作物改良方面的研究均取得了实质性的进展。
（1）在水稻功能基因组研究领域，李家洋研究组分离了控制酚反应的关键基因Phr1，该基因与稻米的耐储存性相关，在水稻耐储存性改良研究中具有很好的应用前景(Yu et al., 2008, Plant Cell)。储成才研究组发现ABA类胡萝卜素前体合成基因的突变导致水稻的穗发芽和光氧化GA/ABA比值变化是导致水稻穗发芽的主要原因 (Fang et al., 2008, Plant Journal)。李传友研究组深入研究了一个水稻矮秆窄叶突变体nal1 (narrow leaf1)，结果表明NAL1基因可能通过调控生长素极性运输影响植物维管排列进而在植物生长发育中起重要作用(Qi et al., 2008, Plant Physiology)。李家洋研究组与周奕华研究组合作，完成了对一个水稻脆秆控制基因BC10的克隆和功能研究工作, 并证明该基因是影响细胞壁合成的重要基因（Zhou et al., 2008, Plant Journal）。李家洋院士应邀为权威刊物Annual Reviews of Plant Biology和Nature Genetics撰写评述，表明国际同行对李家洋院士在相关领域中研究工作的高度认可。
（2）在比较基因组及生物信息学研究领域，陈明生研究组与其合作者测序并比较了9个包含Adh1-Adh2基因的同源染色体组区域，分析表明这个区域的组成复杂性及动态进化发生在大约1千5百万年前 (Ammiraju et al., 2008, Plant Cell) 。此外，陈明生研究组在水稻基因组重复基因的进化研究结果表明，水稻调控与糖类合成代谢的复杂性在基因组加倍后变得更复杂；灌浆期花序中特异表达的新淀粉合成途径反映出这次全基因组加倍事件对禾本科植物进化发生影响的一个重要方面 (Wu, et al., 2008, Mol. Biol. Evol.) 。王秀杰研究组开发了对大规模数据进行Gene Onlotogy分析的在线软件－GOEAST，可以支持对60多个物种在十几个主要数据库中的ID分析，以及对Affymetrix, Illumina, Agilent等公司的芯片探针分析 (Zheng and Wang, 2008, Nucleic Acids Res.)。
（3）在植物表观遗传学研究领域，曹晓风研究组发现在拟南芥Ler和Col-0生态型FLC 启动子附近甲基化修饰的差异与小分子RNA介导的表观遗传修饰差异相关(Zhai et al., 2008, PLoS Genetics)。曹晓风研究组同时也发现拟南芥中两个功能冗余的基因AtPRMT4a和AtPRMT4b在调控开花时间上的重要作用(Niu et al., 2008, Plant Physiology)。在植物与病原菌互作方面的研究中，谢旗研究组证明了RKP是一个有功能的E3连接酶，并且调控细胞周期抑制蛋白ICK/KRP 的稳定性。实验结果表明：被BSCTV病毒C4蛋白诱导的泛素连接酶RKP通过调控植物的细胞周期来影响病毒的侵染 (Lai et al., 2008, Plant Journal)。郭惠珊研究组发现在植物体内瞬时表达的CMV亚基因组能被RNA沉默途径所识别并造成位点特异的剪切。所以通过实验方法在病毒基因组上寻找siRNA-RISC有效进入的剪切热点，是利用amiRNA获得高效病毒抗性的一种既经济又有效的生物工程策略
